Дейността, структурата и организацията на работа, функциите и числеността на Националното управление по горите към Министерството на земеделието и горите се уреждат с Устройствен правилник, приет с Постановление № 167 от 14 август 2000 г. на Министерския съвет на Република България, обнародвано в Държавен вестник, бр. 69 от 22 август 2000 г.
Националното управление по горите е юридическо лице на бюджетна издръжка към Министерството на земеделието и горите със седалище в София. То осъществява функциите на Министерството в областта на горско-стопанската дейност, ловното и непромишленото рибно стопанство. Ръководи се от началник, който се назначава от министъра на земеделието и горите съгласувано с министър-председателя за срок от 5 години без ограничения в броя на мандатите, за които едно лице може да заема тази длъжност. Началникът на НУГ е орган на изпълнителната власт за осъществяване на държавната политика по управлението на държавния горски фонд и контрола върху горите и земите от горския фонд. Той осъществява правомощията си пряко и чрез регионалните управления на горите, държавните лесничейства и поделенията по чл.22, ал.2 от Закона за горите. При осъществяване на своята дейност началникът на НУГ се ръководи от принципите на законност, откритост, достъпност, отговорност и координация в рамките на своята компетентност. НУГ е второстепенен разпоредител с бюджетни кредити към министъра на земеделието и горите.
Издръжката на органите и поделенията на НУГ се осигурява от средствата в Националния фонд "Българска гора". Националното управление по горите е структурирано в обща и специализирана администрация, регионални управления на горите, държавни лесничейства, горски стопанства, държавни дивечовъдни бази и други поделения. Общата численост на персонала в НУГ и в неговите органи и поделения е 9630 щатни бройки.